Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms