Protein–RNA interactions for Protein: P23291

YCK1, Casein kinase I homolog 1, yeast

Predictions only

Length 538 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	P23291	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RTR2	YDR066C	591 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RAD6	YGL058W	519 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RPL9A	YGL147C	576 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	LAG1	YHL003C	1236 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YLR012C	YLR012C	300 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	LSM2	YBL026W	288 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	GAL7	YBR018C	1101 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YPL080C	YPL080C	327 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	SNU56	YDR240C	1479 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	GLC7	YER133W	939 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RTS3	YGR161C	792 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RPL16A	YIL133C	600 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YKR051W	YKR051W	1257 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RGM1	YMR182C	636 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	FPR1	YNL135C	345 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	ATP19	YOL077W-A	207 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YNL034W	YNL034W	1839 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	UTP14	YML093W	2700 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RAX2	YLR084C	3663 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	MDM1	YML104C	3384 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YHL005C	YHL005C	393 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RPL6A	YML073C	531 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	ECM5	YMR176W	4236 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	AHC2	YCR082W	387 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	MXR1	YER042W	555 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YGR018C	YGR018C	330 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	COA4	YLR218C	453 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	SMA2	YML066C	1110 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	COQ10	YOL008W	624 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	CRS5	YOR031W	210 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	PET123	YOR158W	957 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RPS12	YOR369C	432 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YME2	YMR302C	2553 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	ECM25	YJL201W	1800 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RRT13	YER066W	558 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	RPL23B	YER117W	414 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	YGR045C	YGR045C	363 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	SHE9	YDR393W	1371 nt		2.65	□□□□□ -1.98
YCK1	P23291	HMF1	YER057C	390 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RNP1	YLL046C	750 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	SWM2	YNR004W	441 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YPR050C	YPR050C	414 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	UTP13	YLR222C	2454 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	SAP1	YER047C	2694 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YDR220C	YDR220C	294 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	MRPL44	YMR225C	297 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YPL039W	YPL039W	951 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RSE1	YML049C	4086 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	DPB11	YJL090C	2295 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	NDD1	YOR372C	1665 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RGL1	YPL066W	1440 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YAP3	YHL009C	993 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YHR130C	YHR130C	336 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	CMS1	YLR003C	876 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	PBI2	YNL015W	228 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YIL058W	YIL058W	285 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YJR023C	YJR023C	402 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RPL37A	YLR185W	267 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RPB11	YOL005C	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	ATX2	YOR079C	942 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YIL169C	YIL169C	2988 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	GPI8	YDR331W	1236 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	IRC4	YDR540C	540 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	TPM2	YIL138C	486 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	CTK3	YML112W	891 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	GPI15	YNL038W	690 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	LCL1	YPL056C	306 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	TRM7	YBR061C	933 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	MDM32	YOR147W	1869 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YCK1	P23291	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.6	□□□□□ -1.99

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