Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms