Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR1P18146 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms