Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEBPBP17676 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEBPBP17676 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEBPBP17676 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEBPBP17676 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPBP17676 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPBP17676 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPBP17676 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPBP17676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms