Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms