Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms