Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRF1P14222 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms