Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A1P13866 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms