Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms