Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLBP1P12271 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms