Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBSLP0DN79 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms