Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms