Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCP08575 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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