Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD1O95696 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD1O95696 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD1O95696 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRD1O95696 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD1O95696 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD1O95696 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD1O95696 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD1O95696 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms