Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX16O60231 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX16O60231 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX16O60231 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX16O60231 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX16O60231 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX16O60231 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX16O60231 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms