Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms