Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms