Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms