Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCF2LO15068 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms