Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms