Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3KR12 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3KR12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3KR12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
J3KR12 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3KR12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3KR12 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms