Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L11C9JVI0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L11C9JVI0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms