Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms