Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms