Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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