Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WWV3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WWV3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms