Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms