Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQE9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
U3KQE9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
U3KQE9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQE9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U3KQE9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
U3KQE9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U3KQE9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U3KQE9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U3KQE9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms