Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms