Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms