Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN3Q9Y4C0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms