Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAB39Q9Y376 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAB39Q9Y376 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms