Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms