Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA4Q9UN74 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA4Q9UN74 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms