Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRXN1Q9ULB1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms