Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHIC2Q9UKJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms