Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms