Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms