Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms