Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC6Q9UBN7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms