Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms