Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms