Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms