Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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