Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK12Q9NYV4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms