Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALKBH4Q9NXW9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms