Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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