Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms