Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms